Là những thân hoặc cành phồng to lên, chứa chất dự trữ để cây sử dụng khi mọc chồi, ra hoa, tạo quả. Thân củ có hai dạng:

- Thân củ ở trên mặt đất như củ su hào, củ do thân biến đổi thành, chứa chất dự trữ, có chứa diệp lục nên có khả năng tham gia quang hợp cùng với lá cây.

- Thân củ ở dưới mặt đất như củ khoai tây, củ do cành nằm dưới đất biến đổi thành.

Trên thân củ có những mắt mang các sẹo lá, trong nách các sẹo đó chồi nách.

Cùng thực hiện chức năng như thân củ, nhưng thân rễ là thân ngầm ở dưới đất, trông giống như rễ, chứa chất dự trữ. Trên thân rễ có những lá mỏng hình vảy, màu nâu hoặc màu nhạt, trong nách có vảy đó có chồi.

Có loại thân rễ có giống ngắn, như ở các cây: dong ta, gừng, nghệ, riềng ..., hoặc có gióng kéo dài như ở cỏ tranh, cỏ rừng, ....

Một số loài cây sống ở nơi khô hạn, thân thường dài lên rất nhiều do mô nước phát triển, có chức năng dự trữ nước. Toàn thân màu xanh, chứa chất diệp lục làm nhiệm vụ quang hợp thay cho các lá tiêu giảm hoặc sớm rụng. Chất lỏng trong thân có thể dưới dạng nhựa mủ.

Ví dụ: thân xương rồng ta (Euphorbia antiquorum), xương rồng khế (Cereus peruvianus), cành giao ...

Giò thân có thể được hình thành từ chồi nách hay do toàn thân rút ngắn.

  Ở nhiều loài phong lan, giò thân hay phần thân dày lên, chồi ngọn bị tiêu giảm, chỉ mang 1 hoặc 2 lá phát triển bình thường. Từ chồi nách sẽ phát triển thành giò mới.

Một số thân leo thuộc họ củ nâu (Dioscoreaceae) như củ cái, củ từ, giò thân lại phát triển từ mấu và gốc cuống lá. Trong các giò này chứa tinh bột giống như củ ở dưới đất.

Thân hành có dạng dẹt, hình quả lê, hình cầu dẹt gồm các bẹ lá chứa chất dự trữ, xếp úp lên nhau. Các bẹ lá gọi là bẹ hành.

Thân chính rất ngắn (do chồi ngầm ở dưới đất phát triển thành), phía dưới thân mang nhiều rễ phụ, phía trên mang chồi ngọn; chồi nách xen giữa các bẹ lá (vảy).

Từ chồi nách có thể các hành con.

Như vậy ngoài chức năng dự trữ, hành còn có chức năng sinh sản sinh dưỡng.

Một số loài cây sông ở nơi khô hạn, thiếu nước, có lá tiêu giảm, thân hoặc cành có dạng lá, chứa diệp lục và làm chức năng quang hợp. Lá chỉ còn là những vảy nhỏ, sớm rụng. Trong nách những vảy có mọc lên những hoa có cuống, trông như mọc trên lá. Ví dụ: cây quỳnh (Epiphylum oxypetalum), cây càng cua (Zygocatus truncatus).